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本科生科研的那些事儿001版本

按语:最近有几个师弟师妹来问我科研的事情,说实话,每次被问到这个问题的时候我都诚惶诚恐,一方面,我在这方面刚刚起步,读的文献很少,对科研缺乏整体的把握和理解,另一方面,相比于我的同学,我现在也还没开始做文章、投文章,所以说我在这方面说的话很苍白,下面只把我了解到的一些情况和一些比较偏激的看法讲一讲,如果有错误,还请诸君多多指正。

题目写了0.0.1版本,也就是说,随着我对这个问题的认知不断更新,这篇文章会不断完善。

为什么要做科研?

从功利的角度来说,在保研或者考研复试的时候手头上至少有一篇已经发表的文章,无疑具有较大的竞争优势。同时,在北医院里,目前的职务晋升上,科研能力(文章数量、课题基金数量)也是一个重要的评价指标。

从长远的角度来说,医学进入了循证医学、精准医疗的时代,疾病的诊疗过程中需要“有理有据”,同时我们需要找到反映疾病转归更敏感的指标,找到治疗疾病更佳的方案,这一切都依赖于临床和基础科研相结合。

我们可以做哪些方面的科研?

首先我们了解一下常见的sci文章类型。(事实上这个只是个普遍意义上的定义和分类,具体要看杂志的要求)

①Researcharticle:完整的研究论文,耗时最长、耗精力最多

②Review:综述,可以用来锻炼新手文献阅读和写作能力

③Casereport:病例报告(singlecasereport:单例报告,caseseries:多例报告)

④Letters:篇幅较短的研究论文

⑤Comment:评价某些已经发表的成果

⑥Metaanalyse:meta分析

通常如果刚刚接触科研,或者导师给了你一个课题,你都需要搜集并且阅读大量的文献,可以把阅读文献提取出来的框架和重要信息等等写成一篇综述,而在完成了一系列的研究之后,可以投researcharticle或者letter,详细或者简要的阐述自己的研究成果。医院见习、实习过程中,医院接收了某些罕见的或者疑难的病例,可以快速整理出来,尝试发casereport。如果带你的老师长期从事某些专门的临床研究,或者你发现临床上的某些病人在疾病转归过程中存在某些特点,而这些特点没有被重视,你也可以尝试跟老师沟通,得到相关的数据,进行meta分析,但是需要注意的是,metaanalyse热度褪去,除非你的成果能够有效的回应一些临床问题,不然其实比较难投。

如果用酸菜老师对科研类型的分类,即基础研究、临床研究、生信。

基础研究主要涉及的技术包括:细胞的基本操作(如换液、传代、冷冻、复苏等)、免疫组化、染色质免疫共沉淀(ChIp)、RT-PCR、Q-PCR、ELISA、目的基因连接转化克隆筛选、RNA干扰、Northernblot、Westernblot等。

可以看出,做基础研究需要实验室,需要相关的仪器、实验动物、试剂等。可能需要联系基础医学院那边的老师为你提供相关的课题和实验室。

最常见的文章套路:A对象作用于B基因影响C通路进而产生D表型。(分子、基因、通路、表型)。可以上网自己查一下这一类的文章,感受一下。

临床研究,分观察性和实验性,观察性根据有无对照组分为分析性研究(队列研究、横断面研究、病例-对照研究)和描述性研究(病例报告、病例系列),实验性研究包括非随机性研究和随机性研究。

可以看出,做临床研究需要临床上的病例、样本,医院那边的老师为你提供大量的病例样本、临床数据等。

生信,生信其实是一门交叉性学科,涵盖了计算机、数学、生物学、医学等,包括了算法、软件的开发,统计方法、模型的构建比较、具体的分析应用等。医学生常用到的分析技术包括基因组测序分析(WGS、WES等)、转录调控测序分析(Chip-Seq、RNASeq等)、单细胞测序分析(单细胞转录组等)。

可以看出,做生信方面的研究,一方面需要拿到测序的原始数据(基础医学院、医院的老师都有可能拿一些样本去测序),另一方面,需要电脑、服务器等的设备进行相应的分析流程。

最常见的文章套路:从公共数据库中找到相应几个或多个的数据集,找差异基因,进行GO、KEGG、GSEA富集分析,进行分子互作分析,构建分子网络,进行生存分析。可以上网找相关的文章感受一下。

需要说明的是,其实很多高分的研究,可能是三者中的其中两者结合来做的,甚至三者兼具。研究方法、技术的选取,是根据具体的课题特点,根据具体的研究需求来进行。打个比方,比如你通过生信分析筛选出了一些分子,那么你可以进一步的通过体外实验、动物实验,去验证这些分子的作用,同样的,也可以结合临床上患者的病理标本、预后情况等进行分析。

怎么联系课题组?

这里就有几个主要的消息来源了:

①科研站

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